Bioinformatics

网站标签

该站未曾设置keywords

网站描述

HomeofBioinformaticsandInterdisciplinaryTechnologies(BITs)

上一篇：福建师范大学菲律宾研究中心

下一篇：沈阳鳕柏商贸有限公司

网站快照

B i o i n f o r m a t i c s a n d I n t e r d i s c i p l i n a r y T e c h n o l o g i e s ( B I T s ) — Y a n g L a b C o m p u t a t i o n a l B i o l o g y a n d B i o t e c h n o l o g i e s ( Y a n g L a b ) o n g e n o m i c s , t r a n s c r i p t o m i c s a n d g e n o m e e d i t i n g B i o i n f o r m a t i c s a n d I n t e r d i s c i p l i n a r y T e c h n o l o g i e s ( B I T s ) , Y a n g L a b Y a n g L a b H o m e R e s e a r c h N e w s T e a m P u b l i c a t i o n s A w a r d s P i c t u r e s R e s o u r c e s S u p p l e m e n t a r y M a t e r i a l s L o g i n Y a n g L a b . N e w s 2 0 2 6 F e b r u a r y : Y a o Q i , F a n g a n d L i h a v e c o n t r i b u t e d a n a r t i c l e i n C e l l R e s e a r c h . C o n g r a t u l a t i o n s ! 2 0 2 6 J a n u a r y : L i h a s b e e n s e l e c t e d a s o n e o f t h e 2 0 2 5 M o s t C i t e d C h i n e s e R e s e a r c h e r s ( r e l e a s e d b y E l s e v i e r ) . C o n g r a t u l a t i o n s t o L i ! 2 0 2 5 N o v e m b e r : L i h a s b e e n s e l e c t e d a s H i g h l y C i t e d R e s e a r c h e r 2 0 2 5 ( r e l e a s e d b y C l a r i v a t e ) . C o n g r a t u l a t i o n s t o L i ! M o r e F i g 1 . C o m p u t a t i o n a l p i p e l i n e s a n d b i o l o g y o f c i r c R N A s . 1 . G e n o m e w i d e p r o f i l i n g a n d c h a r a c t e r i z a t i o n o f f u n c t i o n a l c i r c R N A s A l t h o u g h o n l y a b o u t 2 % o f t h e h u m a n g e n o m e e n c o d e p r o t e i n s e q u e n c e s , r e c e n t a d v a n c e s i n g e n o m e w i d e a n a l y s e s h a v e r e v e a l e d t h a t t h e m a j o r i t y o f t h e h u m a n g e n o m e a r e t r a n s c r i b e d , l a r g e l y f r o m n o n c o d i n g s e g m e n t s t h a t w e r e u s e d t o b e c o n s i d e r e d a s “ j u n k s e q u e n c e s ” o r “ d a r k m a t t e r ” o f t h e h u m a n g e n o m e . B e s i d e s w e l l c h a r a c t e r i z e d h o u s e k e e p i n g n o n c o d i n g R N A s ( n c R N A s , s u c h a s t R N A , r R N A , s n R N A a n d s n o R N A ) a n d s m a l l r e g u l a t o r y n c R N A s , t h e t r a n s c r i p t o m e h a s b e c o m e e v e n m o r e c o m p l e x w i t h p e r v a s i v e l y t r a n s c r i b e d l n c R N A s ( a t l e a s t 2 0 0 n t l o n g w i t h o u t c o d i n g p o t e n t i a l ) . B y c o l l a b o r a t i n g w i t h e x p e r i m e n t a l b i o l o g i s t s , w e h a v e p i o n e e r e d i n d e v e l o p i n g p o l y ( A ) – R N A s e q a n d r e v e a l e d a s e r i e s o f n o v e l t y p e s o f l n c R N A s w i t h s p e c i f i c s t r u c t u r a l f e a t u r e s , i n c l u d i n g s n o R N A r e l a t e d l n c R N A s ( s n o l n c R N A s ; Y i n e t a l 2 0 1 2 M o l C e l l ; Z h a n g e t a l 2 0 1 4 B M C G e n o m i c s ) , c i r c u l a r i n t r o n i c R N A s ( c i R N A s ; Z h a n g e t a l 2 0 1 3 M o l C e l l ) , 5 ’ s n o R N A c a p p e d a n d 3 ’ p o l y a d e n y l a t e d l n c R N A s ( S P A s ; W u e t a l 2 0 1 6 M o l C e l l ) a n d c o v a l e n t l y c l o s e d c i r c R N A s p r o d u c e d f r o m b a c k s p l i c i n g o f e x o n s ( c i r c R N A s ; Z h a n g e t a l 2 0 1 4 C e l l ) . H e r e , I m a i n l y s u m m a r i z e s y s t e m a t i c f i n d i n g s a n d o u r c u r r e n t u n d e r s t a n d i n g o f c i r c R N A b i o g e n e s i s a n d f u n c t i o n s , i d e n t i f i e d i n m y l a b w i t h c o l l a b o r a t i o n ( F i g . 1 ) . F i g 2 . F r o m e d i t i n g b i o l o g y t o e d i t i n g t e c h n o l o g y . 2 . N u c l e o t i d e e d i t i n g m o d i f i c a t i o n a n d g e n o m e b a s e e d i t i n g t e c h n o l o g i e s B i o c h e m i c a l e d i t i n g / m o d i f i c a t i o n o n D N A / R N A n o t o n l y e x p a n d s t h e n u m b e r o f f u n c t i o n s e n c o d e d b y o u r g e n o m e s b u t a l s o p r o v i d e s a d d i t i o n a l m e c h a n i s m s o f g e n e r e g u l a t i o n . O v e r 1 0 0 d i f f e r e n t t y p e s o f R N A e d i t i n g / m o d i f i c a t i o n s h a v e b e e n i d e n t i f i e d t r a n s c r i p t o m e w i d e . T h e m o s t p r e d o m i n a n t f o r m o f s u c h e d i t i n g / m o d i f i c a t i o n s i n h i g h e r e u k a r y o t e s i s a d e n o s i n e t o i n o s i n e ( A t o I ) e d i t i n g o n R N A , c a t a l y z e d b y m e m b e r s o f a d e n o s i n e d e a m i n a s e s a c t i n g o n R N A ( A D A R ) e n z y m e f a m i l y . A s t h e r e s u l t i n g I p r e f e r e n t i a l l y b a s e s p a i r w i t h c y t i d i n e ( C ) a n d i s t h e r e f o r e f u n c t i o n a l l y g u a n o s i n e ( G ) , A t o I e d i t i n g c a n h a v e p r o f o u n d e f f e c t s o n d o w n s t r e a m R N A p r o c e s s i n g a n d f u n c t i o n , i n c l u d i n g r e c o d i n g o f o p e n r e a d i n g f r a m e s , a l t e r i n g t h e p a t t e r n o f a l t e r n a t i v e s p l i c i n g , i n t e r f e r i n g w i t h m i c r o R N A f u n c t i o n , m o d u l a t i n g R N A i a c t i v i t y , a n d p l a y i n g o t h e r r o l e s i n g e n e r e g u l a t i o n . I n a d d i t i o n t o a d e n o s i n e d e a m i n a s e s , c y t i d i n e d e a m i n a s e s a r e a l s o k n o w n t o b e r e s p o n s i b l e f o r c y t i d i n e d e a m i n a t i o n o n b o t h s i n g l e s t r a n d D N A ( s s D N A ) a n d R N A , c a t a l y z e b y t h e a p o l i p o p r o t e i n B m R N A e d i t i n g e n z y m e , c a t a l y t i c p o l y p e p t i d e l i k e / a c t i v a t i o n i n d u c e d c y t i d i n e d e a m i n a s e ( A P O B E C / A I D ) f a m i l y o f e n z y m e s . A n o t h e r m a j o r f o c u s o f m y l a b i s d e v e l o p i n g n e w c o m p u t a t i o n a l p i p e l i n e s t o g l o b a l l y p r o f i l e n u c l e o b a s e e d i t i n g / m o d i f i c a t i o n e v e n t s a n d t o i n s p e c t p o t e n t i a l c r o s s t a l k b e t w e e n d i f f e r e n t t y p e s o f e d i t i n g / m o d i f i c a t i o n s ( X i a n g e t a l 2 0 1 8 M o l C e l l ) . I m p o r t a n t l y , b y u n d e r s c o r i n g a p r e v i o u s l y u n d e r a p p r e c i a t e d l i n k a g e b e t w e e n A P O B E C s w i t h c l u s t e r e d r e g u l a r l y i n t e r s p a c e d s h o r t p a l i n d r o m i c r e p e a t ( C R I S P R ) C R I S P R a s s o c i a t e d s y s t e m ( C a s ) 9 g e n e r a t e d D N A b r e a k s , m y l a b h a s c o n t r i b u t e d i n t h e g e n o m e e d i t i n g f i e l d b y g e n e r a t i n g a v a r i e t y o f b a s e e d i t i n g s y s t e m s t o p e r f o r m C t o T c h a n g e s a t t a r g e t g e n o m i c s i t e s i n b r o a d g e n o m e b a c k g r o u n d s ( L e i e t a l 2 0 1 8 N a t S t r u c t M o l B i o l ; L i e t a l 2 0 1 8 N a t B i o t e c h n o l ; W a n g e t a l 2 0 1 8 N a t B i o t e c h n o l ; W a n g e t a l 2 0 1 9 G e n o m e B i o l ; W a n g e t a l 2 0 2 0 C e l l R e p ) ( F i g . 2 ) . R e s e a r c h S u m m a r y T h e c o m p l e t i o n o f t h e h u m a n g e n o m e p r o j e c t ( H G P ) i n t h e b e g i n n i n g o f t h i s c e n t u r y a n d t h e a p p l i c a t i o n o f a f f o r d a b l e h i g h t h r o u g h p u t s e q u e n c i n g t e c h n o l o g i e s i n t h e p a s t d e c a d e h a v e l e d l i f e s c i e n c e r e s e a r c h e s t o t h e p o s t g e n o m e e r a . T h e r e s u l t i n g w e a l t h o f d e e p s e q u e n c i n g d a t a s e t s a t g e n o m e ( i n c l u d i n g e p i g e n o m e ) a n d t r a n s c r i p t o m e ( i n c l u d i n g e p i t r a n s c r i p t o m e ) l e v e l s c h a l l e n g e s u s t o f u l l y u n d e r s t a n d h o w f u n c t i o n a l g e n o m i c e l e m e n t s a r e t r a n s c r i b e d a n d r e g u l a t e d , t h u s l e a d i n g t o h u m a n h e a l t h a n d / o r d i s e a s e s . I m p o r t a n t l y , t h e a d v e n t o f n o v e l g e n o m e e d i t i n g t e c h n o l o g i e s p r o v i d e s u s p o w e r f u l m e t h o d s t o c h a n g e g e n e t i c i n f o r m a t i o n a t d e s i r e d t a r g e t s i t e s a t s i n g l e n u c l e o t i d e r e s o l u t i o n , w h i c h b e n e f i t s n o t o n l y b a s i c r e s e a r c h a i m i n g t o d e c i p h e r h o w d i f f e r e n t g e n o t y p e s r e s u l t i n d i s t i n c t p h e n o t y p e s b u t a l s o p r e c l i n i c a l s t u d y p o t e n t i a l t o c u r e h u m a n d i s e a s e s c a u s e d b y g e n e t i c m u t a t i o n s . S i n c e e s t a b l i s h e d i n 2 0 1 1 , m y l a b h a s c o n t i n u o u s l y d e v e l o p e d a n d a p p l i e d c o m p u t a t i o n a l s t r a t e g i e s , i n c l u d i n g t h e s t a t e o f t h e a r t m a c h i n e l e a r n i n g a n d d e e p l e a r n i n g a p p r o a c h e s , t o g e t h e r w i t h d e e p s e q u e n c i n g t e c h n o l o g i e s a n d d i v e r s e b i o c h e m i c a l m e t h o d s , t o d i s s e c t c o m p l e x e x p r e s s i o n , n o v e l f u n c t i o n a n d p o t e n t i a l a p p l i c a t i o n o f l o n g n o n c o d i n g R N A s ( l n c R N A s ) a n d c i r c u l a r R N A s ( c i r c R N A s ) f r o m b a c k s p l i c i n g ; t o a c h i e v e p r e c i s e g e n e t i c c h a n g e s i n t h e a p p l i c a t i o n o f b i o m e d i c a l r e s e a r c h a n d t h e r a p e u t i c s b y t h e i n v e n t i o n o f n o v e l g e n o m e b a s e e d i t i n g s y s t e m s ; t o u n c o v e r p r e v i o u s l y u n d e r a p p r e c i a t e d m o d e s o f R N A r e g u l a t i o n , s u c h a s a l t e r n a t i v e p o l y a d e n y l a t i o n a n d s u b c e l l u l a r l o c a l i z a t i o n , a t s i n g l e c e l l r e s o l u t i o n . R e s e a r c h A c h i e v e m e n t s 1 . G e n o m e w i d e p r o f i l i n g a n d c h a r a c t e r i z a t i o n o f f u n c t i o n a l c i r c R N A s 2 . N u c l e o t i d e e d i t i n g m o d i f i c a t i o n a n d g e n o m e b a s e e d i t i n g t e c h n o l o g i e s 3 . N o v e l m a c h i n e / d e e p l e a r n i n g a p p r o a c h e s f o r t h e u n d e r s t a n d i n g o f R N A r e g u l a t i o n M o r e C o l l a b o r a t o r s P r o f . D r . L i n g L i n g C h e n , S I B C B , S I B S , C A S P r o f . D r . G o r d o n G . C a r m i c h a e l , U C o n n H e a l t h P r o f . D r . J i a C h e n , S h a n g h a i T e c h U n i v e r s i t y L i n k s G i t H u b R e s e a r c h G a t e G o o g l e S c h o l a r L a b M a n a g e r X C o n t a c t A d d r e s s : 科 研 二 号 楼 C B 2 0 4 4 0 4 6 , 1 3 1 D o n g A n R o a d , S h a n g h a i 2 0 0 0 3 1 , P . R . C h i n a T e l e p h o n e : ( + 8 6 ) 0 2 1 5 4 6 6 1 0 8 1 E m a i l : l i y a n g _ f u d a n @ f u d a n . e d u . c n P o w e r e d b y U I K i t a n d F l a s k . © C o p y r i g h t 2 0 1 2 2 0 2 4 B i o i n f o r m a t i c s a n d I n t e r d i s c i p l i n a r y T e c h n o l o g i e s ( B I T s ) , Y a n g L a b . A l l r i g h t s r e s e r v e d . H o m e N e w s A w a r d s P i c t u r e s T e a m P u b l i c a t i o n s R e s o u r c e s S u p p l e m e n t a r y M a t e r i a l s L o g i n

网站说明：

www.yang-laboratory.com由网友主动性提交被名站导航整理收录的，名站导航仅提供网站的基础信息并免费向大众网友展示，www.yang-laboratory.com的IP地址：- 地址：-，百度PC权重为0、百度手机权重为0、百度收录为0条、360收录为0条、搜狗收录为0条、谷歌收录为0条、百度来访流量大约在-之间、百度手机端来访流量大约在-之间、www.yang-laboratory.com的备案号是-、备案主体是-、被百度收录的关键词有0个、手机端关键词有0个、该站点迄今为止已经创建未知。

内容声明：

1、本站收录的内容来源于大数据收集，版权归原网站所有！
2、本站收录的内容若侵害到您的利益，请联系我们进行删除处理！
3、本站不接受违规信息，如您发现违规内容，请联系我们进行清除处理！
4、本文地址：https://www.hornyrob.com/dianyingdh/cde04488a6805315c66d.html，复制请保留版权链接！

---